1.适用范围的有限性。本制度仅适用于对房屋权属登记册记载的房屋所有权真实性的异议，不适用于其他房产权利。或许有人会问：异议登记不就是将以前的人民来信对档案的限制变个形式嘛?其实不然。异议登记是可以将以前一部分人民来信的情况，利用登记的形式进行限制，但不是将人民来信这一形式简单地变更为异议登记。这一特点表明：只有对房屋权属登记册记载的房屋所有权真实性有异议的，才适用于异议登记这一形式。而对于反映房屋租赁纠纷、以房产证作抵押进行借贷未办抵押登记而引起纠纷等情况的人民来信，则不能作为异议登记予以限制。

2.功能上的警示作用。登记异议的功能是警示第三人，即申请人通过登记册上登记异议记载，向可能与登记册记载的权利人发生交易的第三人发出警示信息，以阻断可能进行的交易。权属登记机构受理当事人的异议登记后，其计算机管理系统会将这处房产予以限制转移的提示，一旦登记册上记载的权利人在异议登记有效期内前来办理转移手续，系统会予以提示，告诫发生交易的第三人：该处房产权利归属存在争议，正受异议登记的限制，从而阻断可能进行的交易。

3.登记异议的时效受严格限制。本条规定登记异议满3个月失效。异议登记是一种临时性的救济手段，这条规定的立法意图表明，异议登记仅为权利归属争议当事人进入纠纷程序前提供过渡性保护，为其进入纠纷处理程序的前期准备工作提供必要的时问，同时也约束和防止滥用这一程序性权利，即其确实须为解决权利归属争议而利用这一制度。提出异议登记人可以通过异议登记的这段宽限期，做好进诉讼、仲裁、行政处理程序的准备，最终通过诉讼、仲裁或行政处理程序解决其实体权利归属纠纷。最后，由司法机关或行政复议机关的裁定、仲裁、行政复议结论，或异议登记当事人与权属登记册记载的权利人达成的调解协议等判断异议登记的准确性。如果确认权属登记册记载有误，可予以更正登记。异议登记仅仅是登记异议，而不具更正的效力，更正登记才具有终局性。

4.为保护房屋权属登记册记载的真实权利人因他人滥用异议登记而受到损害，《办法》第四十七条做出了“异议登记记载于房屋权属登记册期满失效后，原申请人就同一事项再次提出登记异议，登记机构不予登记”的规定。对于恶意利用异议登记程序的当事人，如果造成真实权利人损失的，应追究其民事赔偿责任。